numpy.memmap#
- class numpy.memmap(filename, dtype=<class 'numpy.ubyte'>, mode='r+', offset=0, shape=None, order='C')[源代码]#
创建到存储在磁盘上的二进制文件中的数组的内存映射.
Memory-mapped files(内存映射文件)用于访问磁盘上大型文件的小段内容,而无需将整个文件读入内存.NumPy 的 memmap 是类数组对象.这与 Python 的
mmap模块不同,后者使用类文件对象.这个 ndarray 的子类与某些操作有一些令人不快的交互,因为它作为子类不太合适.使用此子类的替代方法是自己创建
mmap对象,然后使用 ndarray.__new__ 直接创建一个 ndarray,并在其“buffer=”参数中传递创建的对象.此类可能在某个时候会变成一个工厂函数,该函数返回 mmap 缓冲区的视图.
刷新 memmap 实例以将更改写入文件. 目前,没有 API 可以关闭底层的
mmap. 很难确保资源确实已关闭,因为它可能在不同的 memmap 实例之间共享.- 参数:
- filenamestr, 类文件对象, 或 pathlib.Path 实例
要用作数组数据缓冲区的文件名或文件对象.
- dtypedata-type,可选
用于解释文件内容的数据类型. 默认为
uint8.- 模式{‘r+’, ‘r’, ‘w+’, ‘c’}, 可选
文件在此模式下打开:
‘r’
打开现有文件以进行只读.
‘r+’
打开现有文件以进行读取和写入.
‘w+’
创建或覆盖现有文件以进行读取和写入. 如果
mode == 'w+',则还必须指定shape.‘c’
Copy-on-write(写入时复制):赋值会影响内存中的数据,但更改不会保存到磁盘. 磁盘上的文件是只读的.
默认为 ‘r+’.
- offset整数,可选
在文件中,数组数据从此 offset 开始. 由于 offset 以字节为单位测量,因此它通常应该是
dtype的字节大小的倍数. 当mode != 'r'时,即使超过文件末尾的正偏移量也是有效的; 文件将被扩展以容纳额外的数据. 默认情况下,即使filename是文件指针fp并且fp.tell() != 0,memmap也将从文件开头开始.- shapeint 或 int 序列, 可选
数组的所需形状.如果
mode == 'r'并且 after offset 之后剩余的字节数不是dtype的字节大小的倍数,则必须指定shape. 默认情况下,返回的数组将是 1-D,其元素数量由文件大小和数据类型决定.在 2.0 版本发生变更: 现在,形状参数可以是任何整数序列类型,以前类型仅限于元组和int.
- order{‘C’, ‘F’},可选
指定ndarray内存布局的顺序 row-major ,C风格或 column-major ,Fortran风格.这仅在形状大于1维时有效.默认顺序是’C’.
参见
lib.format.open_memmap创建或加载内存映射的
.npy文件.
注释
memmap对象可以在接受ndarray的任何地方使用.给定一个memmap
fp,isinstance(fp, numpy.ndarray)返回True.在32位系统上,内存映射文件不能大于2GB.
当memmap导致文件被创建或扩展到文件系统中当前大小之外时,新部分的内容是不确定的.在使用POSIX文件系统语义的系统上,扩展的部分将填充零字节.
示例
>>> import numpy as np >>> data = np.arange(12, dtype='float32') >>> data.resize((3,4))
此示例使用临时文件,以便doctest不会将文件写入您的目录.您将使用“正常”文件名.
>>> from tempfile import mkdtemp >>> import os.path as path >>> filename = path.join(mkdtemp(), 'newfile.dat')
创建一个具有与我们的数据匹配的dtype和形状的memmap:
>>> fp = np.memmap(filename, dtype='float32', mode='w+', shape=(3,4)) >>> fp memmap([[0., 0., 0., 0.], [0., 0., 0., 0.], [0., 0., 0., 0.]], dtype=float32)
将数据写入memmap数组:
>>> fp[:] = data[:] >>> fp memmap([[ 0., 1., 2., 3.], [ 4., 5., 6., 7.], [ 8., 9., 10., 11.]], dtype=float32)
>>> fp.filename == path.abspath(filename) True
将内存更改刷新到磁盘以便读回
>>> fp.flush()
加载memmap并验证数据是否已存储:
>>> newfp = np.memmap(filename, dtype='float32', mode='r', shape=(3,4)) >>> newfp memmap([[ 0., 1., 2., 3.], [ 4., 5., 6., 7.], [ 8., 9., 10., 11.]], dtype=float32)
只读memmap:
>>> fpr = np.memmap(filename, dtype='float32', mode='r', shape=(3,4)) >>> fpr.flags.writeable False
写时复制memmap:
>>> fpc = np.memmap(filename, dtype='float32', mode='c', shape=(3,4)) >>> fpc.flags.writeable True
可以分配给写时复制数组,但值仅写入数组的内存副本,而不写入磁盘:
>>> fpc memmap([[ 0., 1., 2., 3.], [ 4., 5., 6., 7.], [ 8., 9., 10., 11.]], dtype=float32) >>> fpc[0,:] = 0 >>> fpc memmap([[ 0., 0., 0., 0.], [ 4., 5., 6., 7.], [ 8., 9., 10., 11.]], dtype=float32)
磁盘上的文件未更改:
>>> fpr memmap([[ 0., 1., 2., 3.], [ 4., 5., 6., 7.], [ 8., 9., 10., 11.]], dtype=float32)
memmap中的偏移量:
>>> fpo = np.memmap(filename, dtype='float32', mode='r', offset=16) >>> fpo memmap([ 4., 5., 6., 7., 8., 9., 10., 11.], dtype=float32)
- 属性:
- filenamestr 或 pathlib.Path 实例
映射文件的路径.
- offsetint
文件中的偏移位置.
- 模式str
文件模式.
方法
flush()将数组中的任何更改写入磁盘上的文件.